Test d'àcid nucleic
Per test d'àcid nucleic (NAT) és una tècnica que s'utilitza per detectar una seqüència àcid nucleic particular i, per tant, normalment per detectar i identificar una determinada espècie o subespècie d'organisme, sovint un virus o bacteris que actua com a patogen a sang, teixit, orina, etc. Els NAT difereixen altres proves en què detecten materials genètics (ARN o ADN) en lloc de antigen o anticossos. La detecció de materials genètics permet un diagnòstic precoç d'una malaltia perquè la detecció d'antígens i / o anticossos requereix temps perquè comencin a aparèixer al torrent sanguini.[1] Com que la quantitat d'un determinat material genètic sol ser molt petita, molts NAT inclouen un pas que amplifica el material genètic, és a dir, en fa moltes còpies. Aquests NAT s'anomenen proves d'amplificació d'àcid nucleic (NAATs). Hi ha diverses formes d'amplificació, incloent reacció en cadena de la polimerasa (PCR), assaig de desplaçament de cadena (SDA) o assaig mediat per transcripció (TMA).[2]
Aquestes tècniques tenen diversos usos:
- Detecció de la possible presència de virus, com el VIH, el VHB, el VHC a la sang
- Test d'ADN, a les investigacions de la Policia Científica, amb què es compara l'ADN trobat al lloc d'un delicte amb el del presumpte delinqüent.
La reacció en cadena de la polimerasa pertany a aquest conjunt de tècniques.[3]
Història
[modifica]El test va ser desenvolupat es va definir com "una tecnologia que es pot utilitzar per a l'amplificació contínua d'àcids nucleics ".[4]Amb aquest conjunt de tècniques de laboratori, de biologia molecular, és possible multiplicar (amplificar) fins i tot fragments extremadament petits de material genètic (ADN o ARN) de tal manera. per poder-lo identificar i quantificar.
A continuació, s'han fet investigacions sobre les urècies. El 2013, el grup de Seelig va publicar un article sobre sondes fluorescents moleculars que també utilitza la reacció d'intercanvi de mans.[5] Això va permetre la detecció òptica de l'orientació i SNP correctes. També van aconseguir la detecció de SNPs en mostres derivades d'E.Coli.
El 2015, el grup de David va assolir una selectivitat extremadament alta (1.000+) de variants d'un sol nucleòtid (SNVs) introduint el sistema anomenat "composicions competitives".[6]
Aplicacions
[modifica]- Diagnòstic de les infeccions gonocòciques: l'amplificació de seqüències específiques d'ADN o d'ARN de N. per a la detecció de la gonorrea.[7]
- Diagnòstic d'infeccions urogenitals de C. trachomatis [8]
- Detecció de Mycobacterium tuberculosis [9]
- Detecció de l'ARN del VIH [10]
- Detecció de coronavirus zoonòtics [11]
Referències
[modifica]- ↑ «Què és el test de l'àcid nucleic (NAT)?». Creu Roja Americana.
- ↑ Peter A. Leone; Joseph A. Duncan Elsevier. Malalties infeccioses tropicals: Principis, patògens i pràctica (tercera edició), 2011, p. 184–190.
- ↑ (anglès) Compton J. Nucleic acid sequence-based amplification. Nature. 1991;350(6313):91-2.
- ↑ Compton, J «Nucleic acid sequence-based amplification». Nature, 350, 6313, 1991, pàg. 91–2. Bibcode: 1991Natur.350...91C. DOI: 10.1038/350091a0. PMID: 1706072.
- ↑ Georg Seelig, Sherry Chen «Condicionalment sondes fluorescents per detectar Canvis d'una sola base a l'ADN de doble cadena». Nature Chemistry, 5, 9, 2013, pàg. 782–789. Bibcode: ... 5..782C 2013NatCh ... 5..782C. DOI: 10.1038 / NCHEM.1713. PMC: 3844531. PMID: 23965681.
- ↑ David Zhang, Juexiao Sherry Wang «Disseny de sondes d'ADN guiat per simulació per a una hibridació ultraespecífica constantment». Nature Chemistry, 7, 7, 2015, pàg. 545–553. Bibcode: ... 7..545W 2015NatCh ... 7..545W. DOI: 10.1038 / NCHEM.2266. PMC: 4479422. PMID: 26100802.
- ↑ Peter A. Leone, Joseph A. Duncan. Tropical Infectious Diseases: Principles, Pathogens and Practice (Third Edition). Philadelphia: Elsevier, 2011, p. 184–190.
- ↑ Fan, Huizhou. Academic Press. Molecular Medical Microbiology (segona edició), 2015, p. 1449– 1469.
- ↑ Ridderhof, John C. Elsevier. Tuberculosi, 2009, p. 738–745.
- ↑ Gillespie, Susan L. Elsevier. Immunologia clínica (quarta edició), 2013, p. 465–479.
- ↑ Schmidt, Michael; Brixner, Veronika; Ruster, Brigitte; Hourfar, Michael K.; Drosten; Preiser; Seifried, Erhard; Roth, W. Kurt «Cribratge NAT de donants de sang per la síndrome respiratòria aguda greu coronavirus pot prevenir potencialment transmissions associades a la transfusió» (en anglès). Transfusió, 44, 4, 4-2004, pàg. 470–475. DOI: 10.1111 / j.1537-2995.2004.03269.x. ISSN: 0041-1132. PMID: 15043560.
Bibliografia
[modifica]- Coleman, WB i Tsongalis, GJ. Molecular Diagnostics: For the Clinical Laboratorian. Humana Press, 2006. ISBN 1-58829-356-4. pàg. 47-56 i 65-74
- Butler, JM. Forensic DNA Typing: Biology, Technology, and Genetics of STR. Academic Press pgs 63-84, 2005. ISBN 0-12-147952-8.
- Sambrook, Joseph; Russell, David W. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. 3a edició. Cold Spring Harbor (Nova York): Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001. ISBN 0-87969-576-5.
Vegeu també
[modifica]- Test de malalties virals
- Reacció en cadena de la polimerasa
- NASBA
- Polimorfisme de longitud del fragment de restricció
- Alec Jeffreys
- Biologia forense
Enllaços externs
[modifica]- Animació de la PCR (anglès)
- A novel PCR strategy for high-efficiency, automated site-directed mutagenesis (anglès)
- Simulacions en línia de reaccions de PCR davant de diferents seqüenciadors procariotes. (anglès)
- Animació de la PCR(alemany)
- Exercicis en línia en què es dissenyen i simulen experiments de PCR i PCR-RFLP. (castellà)